Коллекция «Ботаника» насчитывает 7949 единиц хранения. Коллекция содержит гербарии флоры Севера известных ботаников А. Н. Бекетова, И. А. Перфильева и А. А. Дедова. Гербарии составляют больше историческую ценность, чем научную, так-как собраны и оформлены примерно в 1870-1880 годы.