Первое упоминание о некоторых предметах из коллекции «Зоология» можно найти в Каталоге Архангельского Городского Публичного музея за 1905 год. На сегодня коллекция насчитывает 1142 единицы хранения и содержит чучела млекопитающих, птиц и шкуры животных.

Особый интерес представляют чучела млекопитающих и птиц, занесенные в Красную книгу Архангельской области. Это белый медведь, морж, орлан белохвост и другие. Уникальной можно назвать коллекцию яиц птиц, обитающих в Архангельской области.